Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SOGA3Q5TF21 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SOGA3Q5TF21 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SOGA3Q5TF21 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SOGA3Q5TF21 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms