Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP2Q5QGT7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTP2Q5QGT7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RTP2Q5QGT7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RTP2Q5QGT7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP2Q5QGT7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTP2Q5QGT7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTP2Q5QGT7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTP2Q5QGT7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP2Q5QGT7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP2Q5QGT7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP2Q5QGT7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP2Q5QGT7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP2Q5QGT7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP2Q5QGT7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP2Q5QGT7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms