Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRMPD3Q5JV73 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMPD3Q5JV73 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms