Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTY5

CBWD3, COBW domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBWD3Q5JTY5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBWD3Q5JTY5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBWD3Q5JTY5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBWD3Q5JTY5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBWD3Q5JTY5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBWD3Q5JTY5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBWD3Q5JTY5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBWD3Q5JTY5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBWD3Q5JTY5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBWD3Q5JTY5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBWD3Q5JTY5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBWD3Q5JTY5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms