Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR44Q5JSH3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR44Q5JSH3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR44Q5JSH3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms