Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf116Q5BN46 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf116Q5BN46 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms