Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL39P5Q59GN2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPL39P5Q59GN2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms