Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
BRDTQ58F21 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRDTQ58F21 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms