Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms