Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPAT3Q53EU6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPAT3Q53EU6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms