Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FNDC1Q4ZHG4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FNDC1Q4ZHG4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms