Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC1LQ4VXU2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PABPC1LQ4VXU2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPC1LQ4VXU2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC1LQ4VXU2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms