Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01620Q4KN68 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01620Q4KN68 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms