Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM50Q3ZCQ8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TIMM50Q3ZCQ8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms