Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TBRG1Q3YBR2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms