Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SP6Q3SY56 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SP6Q3SY56 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms