Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC25A52Q3SY17 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A52Q3SY17 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A52Q3SY17 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms