Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF6Q330K2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDUFAF6Q330K2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFAF6Q330K2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFAF6Q330K2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms