Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P3H1Q32P28 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
P3H1Q32P28 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3H1Q32P28 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms