Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDR2Q16832 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDR2Q16832 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms