Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPN21Q16825 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN21Q16825 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms