Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN1Q16799 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN1Q16799 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTN1Q16799 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
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