Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFA9Q16795 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NDUFA9Q16795 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFA9Q16795 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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