Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
FOXD1Q16676 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FOXD1Q16676 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FOXD1Q16676 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
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