Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 PTMA-210ENST00000467816 378 ntTSL 211.2□□□□□ -0.625e-13■■■■□ 20
SRSF7Q16629 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.456e-8■■■■□ 19.9
SRSF7Q16629 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.79■□□□□ 0.126e-8■■■■□ 19.9
SRSF7Q16629 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.116e-8■■■■□ 19.9
SRSF7Q16629 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.096e-8■■■■□ 19.9
SRSF7Q16629 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 514.39□□□□□ -0.116e-8■■■■□ 19.9
SRSF7Q16629 AC019118.2-202ENST00000419347 416 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.94e-6■■■■□ 19.9
SRSF7Q16629 NFIA-214ENST00000496712 603 ntTSL 34.96□□□□□ -1.622e-11■■■■□ 19.9
SRSF7Q16629 ARHGAP11B-203ENST00000563110 2043 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 19.9
SRSF7Q16629 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 19.9
SRSF7Q16629 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 19.9
SRSF7Q16629 ARHGAP11B-204ENST00000564902 1161 ntTSL 1 (best)5.74□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 19.9
SRSF7Q16629 NARF-225ENST00000584445 2484 ntTSL 210.17□□□□□ -0.783e-6■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 NARF-227ENST00000584965 300 ntTSL 38.44□□□□□ -1.063e-6■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 NARF-222ENST00000583908 430 ntTSL 37.98□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 NARF-226ENST00000584513 500 ntTSL 37.35□□□□□ -1.233e-6■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 RPL32P3-207ENST00000514355 2816 ntTSL 211.53□□□□□ -0.561e-7■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 RPL32P3-206ENST00000510078 2161 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.081e-7■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 RPL32P3-205ENST00000507287 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.11e-7■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 RPL32P3-208ENST00000515866 702 ntTSL 37.79□□□□□ -1.161e-7■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 RPL32P3-204ENST00000507238 363 ntTSL 37.63□□□□□ -1.191e-7■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.213e-21■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.273e-21■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 RPL32P3-202ENST00000499631 593 ntTSL 46.44□□□□□ -1.381e-7■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 CCAR1-205ENST00000483264 487 ntTSL 54.74□□□□□ -1.653e-6■■■■□ 19.8
SRSF7Q16629 TMEM74B-203ENST00000481747 582 ntTSL 222.41■■□□□ 1.184e-7■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 KTN1-215ENST00000554567 730 ntTSL 520.5■□□□□ 0.876e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.66e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 BPTF-208ENST00000544778 7573 ntTSL 516.91■□□□□ 0.36e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.216e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.034e-11■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 ZYX-205ENST00000446634 926 ntTSL 514.56□□□□□ -0.086e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.116e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 ZYX-204ENST00000436448 632 ntTSL 413.78□□□□□ -0.26e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.216e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 TMEM74B-202ENST00000429036 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.07□□□□□ -0.324e-7■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 ZYX-202ENST00000354434 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.84□□□□□ -0.356e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.374e-11■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.396e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.424e-11■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 PFKP-207ENST00000421751 658 ntTSL 412.39□□□□□ -0.436e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 212.36□□□□□ -0.436e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 HNRNPH3-206ENST00000478698 1507 ntTSL 212.01□□□□□ -0.496e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.534e-11■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.546e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.544e-11■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.546e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.554e-11■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.556e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.564e-11■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 PFKP-204ENST00000407806 705 ntTSL 511.46□□□□□ -0.576e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.616e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.616e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.644e-11■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 CBFA2T3-210ENST00000569464 1327 ntTSL 1 (best)10.91□□□□□ -0.666e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.684e-11■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 PFKP-212ENST00000607886 432 ntTSL 510.67□□□□□ -0.76e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 510.49□□□□□ -0.736e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 SLC25A21-205ENST00000557611 591 ntTSL 510.17□□□□□ -0.786e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.786e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 CBFA2T3-203ENST00000562719 539 ntTSL 59.44□□□□□ -0.96e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.926e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 SLC25A21-201ENST00000331299 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.946e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.096e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 BPTF-203ENST00000335221 2627 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.146e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 AC069277.1-204ENST00000342990 246 ntTSL 36.07□□□□□ -1.446e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.676e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 BPTF-205ENST00000424123 8295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)4.64□□□□□ -1.676e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.674e-11■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.674e-11■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.696e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.696e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.76e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.914e-11■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.976e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.046e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 KTN1-208ENST00000459737 4793 ntTSL 1 (best)2.07□□□□□ -2.086e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.16e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.16e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.136e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.196e-6■■■■□ 19.7
SRSF7Q16629 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.626e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GNB1-207ENST00000472614 708 ntTSL 218.4■□□□□ 0.546e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.386e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.376e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.326e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 POR-206ENST00000421059 631 ntTSL 416.73■□□□□ 0.276e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.256e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.246e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.26e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ETV5-203ENST00000421809 554 ntTSL 216.21■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.186e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 CHD9-208ENST00000563410 488 ntTSL 216.07■□□□□ 0.166e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 Z98883.1-201ENST00000409439 916 ntTSL 316.01■□□□□ 0.156e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.16e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.026e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.026e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 PIGQ-202ENST00000293874 603 ntTSL 414.99□□□□□ -0.016e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 ETV5-210ENST00000476890 642 ntTSL 214.86□□□□□ -0.036e-6■■■■□ 19.6
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