Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
STX1AQ16623 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STX1AQ16623 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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