Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGCBQ16585 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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