Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC18A3Q16572 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms