Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRNP35Q16560 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP35Q16560 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRNP35Q16560 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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