Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIK5Q16478 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIK5Q16478 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIK5Q16478 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
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