Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMA4Q16363 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMA4Q16363 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA4Q16363 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
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