Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA3Q16281 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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