Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGN3Q15651 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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