Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNHIT3Q15649 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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