Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SEC23AQ15436 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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SEC23AQ15436 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEC23AQ15436 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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SEC23AQ15436 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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SEC23AQ15436 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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SEC23AQ15436 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
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