Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NR6A1Q15406 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR6A1Q15406 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR6A1Q15406 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
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