Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF4Q15306 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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