Protein–RNA interactions for Protein: Q15031

LARS2, Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARS2Q15031 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LARS2Q15031 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LARS2Q15031 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LARS2Q15031 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LARS2Q15031 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LARS2Q15031 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LARS2Q15031 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LARS2Q15031 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LARS2Q15031 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LARS2Q15031 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LARS2Q15031 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LARS2Q15031 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LARS2Q15031 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms