Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCLAFQ15004 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCLAFQ15004 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCLAFQ15004 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCLAFQ15004 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCLAFQ15004 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCLAFQ15004 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCLAFQ15004 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCLAFQ15004 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCLAFQ15004 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms