Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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ODF1Q14990 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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