Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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RAB39AQ14964 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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RAB39AQ14964 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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RAB39AQ14964 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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RAB39AQ14964 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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RAB39AQ14964 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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RAB39AQ14964 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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RAB39AQ14964 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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RAB39AQ14964 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB39AQ14964 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB39AQ14964 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB39AQ14964 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB39AQ14964 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB39AQ14964 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB39AQ14964 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB39AQ14964 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB39AQ14964 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB39AQ14964 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB39AQ14964 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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