Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX2Q14781 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CBX2Q14781 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX2Q14781 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms