Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFTN1Q14699 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFTN1Q14699 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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