Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBE4AQ14139 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
UBE4AQ14139 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms