Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE1CQ14123 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE1CQ14123 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE1CQ14123 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms