Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CNGB1Q14028 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CNGB1Q14028 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CNGB1Q14028 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CNGB1Q14028 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
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