Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA4Q13772 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA4Q13772 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA4Q13772 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA4Q13772 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA4Q13772 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA4Q13772 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCOA4Q13772 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCOA4Q13772 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCOA4Q13772 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
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