Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALCAMQ13740 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALCAMQ13740 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALCAMQ13740 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALCAMQ13740 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
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