Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KRR1Q13601 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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