Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SQSTM1Q13501 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQSTM1Q13501 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SQSTM1Q13501 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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